怀孕40天是可以进行流产的，可以采用药物流产，也可以采用人工流产，但是流产之前需要先去医院做一些化验检查，排除了流产的禁忌症之后才可以进行流产。需要做心电图，需要做妇科彩超，需要抽血化验血细胞分析、凝血分析的。